蛋白PDB文件格式[通俗易懂]

全栈程序员-站长 • 2022年6月1日下午5:46 • 未分类 • 阅读 28

蛋白PDB文件格式[通俗易懂]列数据类型字段名称定义描述1-6 Recordname”DBREF”8-11IDcode idCode 记录的ID号13 Character

大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。

列	数据类型	字段名称	定义描述
1 – 6	Record name	“DBREF “
8 – 11	IDcode	idCode	记录的ID号
13	Character	chainID	链的标识符
15 – 18	Integer	seqBegin	PDB序列片段的起始序列号
19	AChar	insertBegin	PDB序列片段的起始插入代码
21 – 24	Integer	seqEnd	PDB序列片段的终止序列号
25	AChar	insertEnd	PDB序列片段的终止插入代码
27 – 32	LString	database	序列数据库名称如PDB，SWS，当一个相应的序列数据库记录还未识别时即存放PDB
34 – 41	LString	dbAccession	序列数据库的访问号码，如对于GenBank来说即是NCBI gi
43 – 54	LString	dbIdCode	序列数据库的识别密码，对GB来说即是访问号码
56 – 60	Integer	dbseqBegin	数据库片段的起始序列号
61	AChar	idbnsBeg	涉及到PDB的话，存放片段起始残基的插入代码
63 – 67	Integer	dbseqEnd	数据库片段的终止序列号
68	AChar	dbinsEnd	涉及到PDB的话，存放片段终止残基的插入代码。

原文出自：蛋白质PDB文件说明.doc

英文版：PDB Primary Structure Section

from:Valeri Barsegov Molecular Dynamics Simulations: Lecture 16 & 17

转自：http://blog.sina.com.cn/s/blog_6264e0aa0102edyr.html

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