roc曲线的意义_实用!Biomarker表达差异图、ROC曲线&四格表的实操手册「建议收藏」

roc曲线的意义_实用!Biomarker表达差异图、ROC曲线&四格表的实操手册「建议收藏」解螺旋·蘑菇老师详细讲解biomarker研究在课题设计方面需要注意的一些共性问题,包括标本类型、样本收集以及病例资料三大部分。本期课程则汇总了biomarker研究中的典型图表以形成”图表九宫格“,并着重讲解有关biomarker表达差异(基础表达和变化趋势)、诊断标志(ROC曲线和四格表)的相关图表;同时,依据模拟数据,实操演示Graphpad、SPSS软件制作相关图表的具体步骤,学员们可按照…

大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。

解螺旋·蘑菇老师详细讲解biomarker研究在课题设计方面需要注意的一些共性问题,包括标本类型、样本收集以及病例资料三大部分。

本期课程则汇总了biomarker研究中的典型图表以形成”图表九宫格“,并着重讲解有关biomarker表达差异(基础表达和变化趋势)、诊断标志(ROC曲线和四格表)的相关图表;

b545a237ce5b1efa6f25c08e9deb0b63.png

同时,依据模拟数据,实操演示Graphpad、SPSS软件制作相关图表的具体步骤,学员们可按照课程讲解步骤将实际研究数据快速出图。

一,大家在制作biomarker研究图表时,需要先了解所投期刊对文章的要求,而后依据作图的三大原则(视觉区分、色彩搭配和对称平衡)直接生成符合要求的图片和文件,省去后续处理的麻烦。

4f81195a5dd4645aa5184921a7ec3a24.png

6ab016f13c779acd6c46618bac41afa0.png

40dbf29fdc0e3802208063e9727053b4.png

课程则详细讲解了Biomarker筛选的分子类型和”筛猜“策略。

e3d1209e1022227909003d676dbce1c1.png

4785581048c826415109d9fc445ff544.png

二,通常biomarker的表达差异图可分为两大类,一类针对不同的个体的分子表达差异,包括柱状图、箱式图和散点图;

一类针对同一个体,如治疗前后的分子表达差异,或肿瘤和癌旁组织的表达差异,这些数据多是用趋势图来表示的。

因Graphpad在录入数据后可对数据的呈现方式进行相应的调整,则针对上述四类图型只要掌握了其中一种,其他触类旁通、举一反三即可。

课程实例演示了柱状图和独立t检验的具体操作方法。

1.柱状图

e1e061a6793848013472e6247dadd55f.png

cc48da4e04e88a7fa537029af06f873b.png

fe7f5bb5e546b3e0d19812ed80bc9119.png

c417df26748929c8ffa422d4851913be.png

2.独立t检验

2b1b3c48bf44e4a40a3f49941fb847ab.png

181860c7ab05e72fac63f3b96eaf70b3.png

df5d165dd24ac1c7db44df38dfb4144b.png

f2ed4ba4b1580d36597db3b663e84538.png

0b91a9d76d5d331e79d40336a0009b45.png

b483eec611f7c283330a2a71dd2b6210.png

三,当Biomarker研究涉及到诊断的意义时,还要再引入一个数据图——ROC曲线图。

该图是用来评估一种检测方法与另一种金标准的检测方法之间敏感性和特异性的差别,可表征一种新的诊断方法与传统的策略相比诊断效能如何。

fed8ada025c05781e5258bb445537da1.png

同样课程以模拟数据为例,演示了如何通过SPSS软件绘制ROC曲线的具体方法。

f970c4e1111e8f4074c81dbbbe0dafac.png

f4c8829b32d35e796822c33e35d97395.png

4e1f28a201c33db0dc7d7a65946678e1.png

6396fc7a5b880413627c9229a9521f6a.png

d11d50b3b19a39d4937a3baff66cef8d.png

四,临床诊断型实验指的是判断罹患疾病的检测方法,包括实验室检测法和影像学方法,目的是辅助诊断和筛查体验。

8559e9d286dfdfe4500a75b0020c2e23.png

不论是研究新的诊断标准,还是实验室指标对疾病的诊断价值,或是对预后的诊断,均涉及到试验的阳性与阴性、标准诊断的某病与非某病四种情况,因此要用四格表进行运算。

7008ba527ce7e483f46904fc8309b940.png

935e2625bb1cb2b4529fc118e3fe3610.png

同样,课程以一个模拟案例,也介绍了四格表计算的在线绘制方法和Excel表格绘制法。

224db6d556fe9adb31465b6da1981c50.png

1.在线操作法

d3bfb2eb294e02a32a95822415511f0a.png

049012fba57771dc5e76c5e34cfcecba.png

2.Excel实操法

a24b7b9f6fb0c24cfe24da537ac1838a.png

a7327ac08f75332f926b8bfc0ae55ecc.png

作者:子非鱼

本文首发于“ 解螺旋”微信公众号

转载请注明:解螺旋·临床医生科研成长平台

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请联系我们举报,一经查实,本站将立刻删除。

发布者:全栈程序员-站长,转载请注明出处:https://javaforall.net/145530.html原文链接:https://javaforall.net

(0)
全栈程序员-站长的头像全栈程序员-站长


相关推荐

  • 10个的常用PyCharm插件

    10个的常用PyCharm插件安装方法先来说说插件的安装方法,一点都不难。选择顶部菜单栏的PyCharm选项,打开Preferences,点击plugins,在右侧的文本框中输入想要查看的插件名称,在下方就会罗列出已经安装的相关的插件。找到我们所需要的对应插件之后,点击install即可完成下载,然后重启一下Pycharm即可插件介绍1、MaterialThemeUILite该插件的作用在于能够为Pycharm提供多种不同的页面风格。设置:选择顶部菜单栏的PyCharm选项,打开Pref

    2022年6月24日
    61
  • hive regex insert join group cli

    hive regex insert join group cli

    2021年12月7日
    40
  • 阿里云部署django实现公网访问

    本博的主要目的是对阿里云部署django实现公网访问进行一次简单的记录,方便日后查询。内容目录:(1)申请阿里云服务器及安全组配置(2)实现ssh远程控制(3)实现ftp文件传输(4)安装p

    2021年12月29日
    41
  • C语言:求最大公约数和最小公倍数「建议收藏」

    C语言:求最大公约数和最小公倍数「建议收藏」记录自己的c语言学习过程输入两个正整数,分别求出最大公约数和最小公倍数代码:#include<stdio.h>intmain(){ intm,n,a,b; printf("输入两个正整数:"); scanf("%d%d",&m,&n); if(m&am

    2022年5月17日
    41
  • 1000个微信小程序源码分享[通俗易懂]

    1000个微信小程序源码分享[通俗易懂]文章目录微信小程序源代码获取开发账号注册小程序部分源码展示程序展示微信小程序现在的微信小程序非常火爆,网上也有很多学习资源,但是源码资源还是很少的。其实在学习开发微信小程序的时候如果有源码可以供我们借鉴,学习效率也会成倍的增加。无论是前端开发,还是后端开发,时间长了,你总会能总结出它的一些规律的,对于前端开发主要就两条,页面展现,逻辑处理。如果是全流程开发的话,那就是,如何创建项目,页面如何实现,数据获取和逻辑处理如何实现,如何打包上线。移动端或者前端,基本开发流程就这个四个步骤。所以在在前端方面去学

    2022年9月17日
    0
  • 安卓数据转移到iphone老是中断_安卓换iPhone数据怎么转移?这款神器一键搞定「建议收藏」

    安卓数据转移到iphone老是中断_安卓换iPhone数据怎么转移?这款神器一键搞定「建议收藏」每天12:18准时给大家惊喜!大家好!我是好奇仔,热衷于搜罗和分享各种好用、实用的软件神器和资源,有手机软件、办公软件、APP,还有网站资源……来自:PConline,作者:我爱我家换新手机了,内心当然是巨爽无比了!可是换机时有个步骤却让人觉得有点麻烦,那就是如何将旧手机的资料转移到新手机里去,安卓与iOS又如何互通呢?以前的操作得先将数据导出到电脑,然后可能还需要进行数据格式转换,接…

    2022年5月26日
    187

发表回复

您的邮箱地址不会被公开。 必填项已用 * 标注

关注全栈程序员社区公众号