ggplot2数据分析与图形艺术_plot画多条曲线

ggplot2数据分析与图形艺术_plot画多条曲线接着我们之前复现过的一篇NC文章(复现《naturecommunications》散点小提琴图+蜜蜂图),有一张关于差异蛋白的火山图,但是不同的是他的阈值设定不是我们普通的横向纵向,而是曲线阈值!image.png本来我以为这是一个个例,本篇文章作者博眼球的做法,但是检索了一下发现我付肤浅了,有很多文章,但是有一个特点,双曲线阈值应用在蛋白组差异基因的筛选上,这样的方式类似与“软阈值”吧,能够找到更显著的蛋白,值得在自己的研究中使用。image.png(Reference:ProteomicsofMe

大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。如果您正在找激活码,请点击查看最新教程,关注关注公众号 “全栈程序员社区” 获取激活教程,可能之前旧版本教程已经失效.最新Idea2022.1教程亲测有效,一键激活。

Jetbrains全系列IDE稳定放心使用

接着我们之前复现过的一篇NC文章(复现《nature communications》散点小提琴图+蜜蜂图),有一张关于差异蛋白的火山图,但是不同的是他的阈值设定不是我们普通的横向纵向,而是曲线阈值!

ggplot2数据分析与图形艺术_plot画多条曲线

image.png

本来我以为这是一个个例,本篇文章作者博眼球的做法,但是检索了一下发现我付肤浅了,有很多文章,但是有一个特点,双曲线阈值应用在蛋白组差异基因的筛选上,这样的方式类似与“软阈值”吧,能够找到更显著的蛋白,值得在自己的研究中使用。

ggplot2数据分析与图形艺术_plot画多条曲线

image.png

(Reference:Proteomics of Melanoma Response to Immunotherapy Reveals Mitochondrial Dependence)

ggplot2数据分析与图形艺术_plot画多条曲线

image.png

(Reference:Proteomics in cerebrospinal fuid and spinal cord suggests UCHL1, MAP2 and GPNMB as biomarkers and underpins importance of transcriptional pathways in amyotrophic lateral sclerosis)

ggplot2数据分析与图形艺术_plot画多条曲线

image.png

(Reference:Platelet-Derived Microparticles From Obese Individuals: Characterization of Number, Size, Proteomics, and Crosstalk With Cancer and Endothelial Cells)

****============================================================================****

这个图的做法和之前我们写过的ggplot做火山图同根同源(ggplot做火山图—添加任意基因标签|||突出显示标记基因)。我们的复现结果基本和这篇NC是一样的,有以下特点:

1、上下调基因阈值使用曲线。

2、上下调基因用不同颜色显示,且大小自定义,并显示基因名称。

****============================================================================****

ggplot2数据分析与图形艺术_plot画多条曲线

image.png

更多精彩内容请关注我的公众号《KS科研分享与服务》!

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除。

发布者:全栈程序员-站长,转载请注明出处:https://javaforall.net/189466.html原文链接:https://javaforall.net

赞 (0)
全栈程序员-站长的头像全栈程序员-站长


相关推荐

  • 最小生成树,克鲁斯卡尔算法入门。

    最小生成树,克鲁斯卡尔算法入门。

    2021年9月27日
  • c++ sstream

    c++ sstreamsstream定义了三个类:istringstream、ostringstream和stringstream分别用来进行流的输入、输出和输入输出操作由于sstream使用string对象代替字符数组,避免缓冲区溢出的危险;其次,因为传入参数和目标对象的类型会被自动推导出来,所以不存在错误的格式化符的问题。相比c库的数据类型转换,sstream更加安全、自动和直接。1.数据类型转换#inclu…

    2022年6月4日
  • 修改RAC环境中的ASM DG名称

    修改RAC环境中的ASM DG名称

    2021年7月5日
  • 移动端开发流程[通俗易懂]

    移动端开发流程[通俗易懂]一、确定项目技术栈vue2.0+vue-cli3/4+vue-router+axios+vuex+vant+rem+sass+webpack二、搭建推荐使用yarnyarn,npm(cnpm)包管理工具yarnaddaxios-Scnpminstallaxios-S-S:–save-dev生产环境的依赖(dependencies)-D:–dev开发环境的依赖(devDependencies)从0开始搭建首先我们要创建一

    2022年6月24日
  • Java 最长递增子序列_最长递增子序列问题 Java

    Java 最长递增子序列_最长递增子序列问题 Java最长递增子序列问题LIS(longestincreasingsubsequence)例如给定一个数列,长度为N,求这个数列的最长上升(递增)子数列(LIS)的长度.以1,7,2,8,3,4为例。这个数列的最长递增子数列是1234,长度为4;次长的长度为3,包括178;123等.设数组为:arr设foo(k)为:以数列中第k项(为了与java数组逻辑…

    2022年6月10日
  • Loadrunner教程–常用操做流程[通俗易懂]

    Loadrunner教程–常用操做流程[通俗易懂]作者博客:vps精选网1loadrunner压力测试一般使用流程1.1loadrunner压力测试原理本质就是在loadrunner上模拟多个用户同时按固定行为访问web站点。其中固定行为在loadrunner中是通过录制脚本定义的,多个用户同时访问的策略是在loadrunner的场景中定义的。1.2压测思路通过loadrunner进行压力测试web应用的主要思路分两步:第…

    2022年5月24日

发表回复

您的邮箱地址不会被公开。 必填项已用 * 标注

关注全栈程序员社区公众号