miRbase 是miRNA 的数据库，目前最新版本为 release 21, 共有28645 条 miRNA, 第22 版已经完成，即将发布，22版新增了10000 个miRNA, 大多来源于新的物种。
21版的数据库中收录了 223 个物种的miRNA, 根据 phylum 水平分成以下几类：
1）Metazoa ： 后生动物
最常见的人， 小鼠， 大鼠， 鸡， 狗， 牛， 羊等等
2） Viridiplantae ： 绿色植物界
最常见的拟南芥， 水稻， 玉米，小麦，大麦等等
3）Chromalveolata ： 囊泡藻界
4）Mycetozoa ：黏菌
5） Viruses ： 病毒
网址：
http://www.mirbase.org/index.shtml
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