转录调控必知数据库ENCODE，介绍及使用方法[通俗易懂]

全栈程序员-站长 • 2022年10月29日下午6:46 • 未分类 • 阅读 0

转录调控必知数据库ENCODE，介绍及使用方法[通俗易懂]按照上图的展示，目前的ENCODE通过多种测序数据来反应基因组变化的过程，分别是通过 Hi-C来观察三维基因组 ATAC-seq/chip-seq研究基因的转录调控甲基化芯片来研究甲基化的调控作用 RNA-seq来研究基因表达的变化 RIP-seq研究在转录后调控的信息我们可以通过ENCODE数据库来检索自己想要的数据。类似很多转录调控数据库也是在ENCODE数据库获得目标原始数据后，进行分析后构建的自己数据库。文…

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按照上图的展示，目前的ENCODE通过多种测序数据来反应基因组变化的过程，分别是通过

Hi-C 来观察三维基因组
ATAC-seq/chip-seq 研究基因的转录调控
甲基化芯片来研究甲基化的调控作用
RNA-seq 来研究基因表达的变化
RIP-seq 研究在转录后调控的信息

我们可以通过ENCODE数据库来检索自己想要的数据。类似很多转录调控数据库也是在ENCODE数据库获得目标原始数据后，进行分析后构建的自己数据库。

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