TCGA官方的网站链接是：https://portal.gdc.cancer.gov/
https://portal.gdc.cancer.gov/
下面介绍一个各个方便快捷的数据库，即是UCSC xena，链接是 UCSC Xenahttp://xena.ucsc.edu/
这是数据库的主界面，现在已经改版：
下面直接说数据库怎么下载。
滑动滚轮至页面下方：
点击learn more。
点击launch Xena。
点击data hubs。
红框即是整理好的TCGA数据库。
我们点击TCGA hub：
可以看到这里包含了33种癌症组织的数据。
但是TCGA hub不及GDC好用，因为没有对应的癌旁组织。因此，下载TCGA hub里面的测序数据库时，没办法进行差异表达分析。所有推荐选择GDC hub：
GDC hub种除了TCGA数据库以外，还有别的平台数据，例如Target。
下面我们点击一个癌症进去看一看：
这是食管癌的数据，可以看到里面的数据时非常丰富的，包含mRNA测序数据，拷贝数变异数据，突变数据，miRNA数据，临床数据等。
要研究哪个癌症就下载哪个数据吧。
版权声明：本文内容由互联网用户自发贡献，该文观点仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务，不拥有所有权，不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容， 请联系我们举报，一经查实，本站将立刻删除。
发布者：全栈程序员-站长，转载请注明出处：https://javaforall.net/226551.html原文链接：https://javaforall.net
