1.实验设计考虑
生物体中总RNA=(~90%)rRNA+ (1~2%)mRNA+(8~9%)其他RNA
2.建库过程
1)总RNA提取
提取后的总RNA要进行纯度(purity)、浓度(quantity)、完整性(RIN)的质量检查。
不同样品的total RNA中mRNA含量差异较大,若total RNA起始投入量过低,不能保证有足够的mRNA用于后续建库,因此建议RNA起始量为1~4μg。
不同RIN(RNA intergrity number)示意图:(从1~10为bad to good)
2)mRNA分离与片段化
3)cDNA第一链合成
随机六聚体引物(random hexamer primer),逆转录酶以mRNA为模版合成cDNA
4)cDNA第二链合成
5)双链cDNA的末端修复
末端补齐,再纯化修复后的cDNA。ds cDNA3‘端加A(dA – tailing)。
6) 连接接头
然后纯化连接了接头的 ds cDNA
7)PCR富集文库
扩增完纯化后,进行文库质检,质检完的文库就可以拿去上机测序了。
The End
怀念那些无所事事一整个夏天的年少
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