UCSC基因组浏览器,比老东家还出名的数据库

最先搜索出来的是UCSC Genome Browser,其次才是他的老东家 加州大学圣克什么。。分校(当然,这不重要…)
果然是一款比老东家还要出名的基因组数据库。
因为平时工作中经常会用到这个数据库,宝藏一般汇聚了各类信息,使你的工作事半功倍。所以计划仔细研究下这个数据库,同时整理出来分享给大家。
UCSC Genome Database(http://genome.ucsc.edu/)是加州大学圣克鲁兹分校(UCSC)创立和维护的一个重要的生物学数据库,也是基因组研究过程中广泛使用的数据库。它包含了大量基因组数据,包括 基因注释信息(ENCODE )、基因组间的比对信息、重复序列、同源序列、 参考序列(mRNA, EST )、表型、表达谱、调控信息、保守性、变异、重复区域等一系列信息
- Mapping and Sequencing
- Genes and Gene Predictions
- Phenotype and Literature
- mRNA and EST
- Expression
- Regulation
- Comparative Genomics
- Neandertal Assembly and Analysis
- Denisova Assembly and Analysis
- Variation
- Repeats
每个模块下又包含了诸多子类,我会逐一的对每个模块进行介绍。
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