【UCSC Genome Browser】比老东家还出名的基因组数据库

【UCSC Genome Browser】比老东家还出名的基因组数据库UCSC 基因组浏览器 比老东家还出名的数据库对于生命科学从业者来讲 UCSC 基因组浏览器可能并不陌生 这可是基因组的大百科全书 但是 UCSC 是什么呢 好像是加州大学 什么 什么 分校 好吧 我们一起百度下 UCSC 最先搜索出来的是 UCSCGenomeBr 其次才是他的老东家加州大学圣克什么 分校 当然 这不重要 果然是一款比老东家还要出名的基因组数据库 因为平时工作中经常会用到这个数据库 宝藏一般汇聚了各类信息 使你的工作事半功倍 所以计划仔细研究下这个数据库

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【UCSC Genome Browser】比老东家还出名的基因组数据库

最先搜索出来的是UCSC Genome Browser,其次才是他的老东家 加州大学圣克什么。。分校(当然,这不重要…)

果然是一款比老东家还要出名的基因组数据库。

因为平时工作中经常会用到这个数据库,宝藏一般汇聚了各类信息,使你的工作事半功倍。所以计划仔细研究下这个数据库,同时整理出来分享给大家。

UCSC Genome Database(http://genome.ucsc.edu/)是加州大学圣克鲁兹分校(UCSC)创立和维护的一个重要的生物学数据库,也是基因组研究过程中广泛使用的数据库。它包含了大量基因组数据,包括 基因注释信息(ENCODE )、基因组间的比对信息、重复序列、同源序列、 参考序列(mRNA, EST )、表型、表达谱、调控信息、保守性、变异、重复区域等一系列信息

  • Mapping and Sequencing
  • Genes and Gene Predictions
  • Phenotype and Literature
  • mRNA and EST
  • Expression
  • Regulation
  • Comparative Genomics
  • Neandertal Assembly and Analysis
  • Denisova Assembly and Analysis
  • Variation
  • Repeats

    每个模块下又包含了诸多子类,我会逐一的对每个模块进行介绍。

【UCSC Genome Browser】比老东家还出名的基因组数据库
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