大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。如果您正在找激活码,请点击查看最新教程,关注关注公众号 “全栈程序员社区” 获取激活教程,可能之前旧版本教程已经失效.最新Idea2022.1教程亲测有效,一键激活。
Jetbrains全家桶1年46，售后保障稳定
软件下载网址：http://software.genetics.ucla.edu/admixture/download.html
#使用vcftools进行格式转换，plink.ped与plin.map文件
vcftools --vcf maftest.vcf --plink --out adsaixuan
#过滤SNP文件
plink --noweb --file adsaixuan --hwe 0.0001 --make-bed --out QC
#群体结构分析，设置K（如1-7）
for K in 1 2 3 4 5 6 7; do admixture_linux-1.3.0/admixture --cv QC.bed $K | tee log${K}.out; done
#提取出CV值
grep -h CV log*.out
CV error (K=1): 0.55248
CV error (K=2): 0.48190
CV error (K=3): 0.47835
CV error (K=4): 0.48236
CV error (K=5): 0.48985
#值越小越好相关参考网站：
【一起学生信】群体结构图形—structure堆叠图_探索者v的博客-CSDN博客_structure群体结构
科学网—群体结构分析之Structure 篇完整版（By Raindy） – 高芳銮的博文
Admixture：一款快速分析群体遗传结构的软件_.ped
版权声明：本文内容由互联网用户自发贡献，该文观点仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务，不拥有所有权，不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容， 请联系我们举报，一经查实，本站将立刻删除。
发布者：全栈程序员-站长，转载请注明出处：https://javaforall.net/210766.html原文链接：https://javaforall.net
![点积与叉积[通俗易懂]](https://javaforall.net/wp-content/uploads/2020/11/2020110817443450-480x300.jpg)
