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软件下载网址：http://software.genetics.ucla.edu/admixture/download.html
#使用vcftools进行格式转换，plink.ped与plin.map文件
vcftools --vcf maftest.vcf --plink --out adsaixuan
#过滤SNP文件
plink --noweb --file adsaixuan --hwe 0.0001 --make-bed --out QC
#群体结构分析，设置K（如1-7）
for K in 1 2 3 4 5 6 7; do admixture_linux-1.3.0/admixture --cv QC.bed $K | tee log${K}.out; done
#提取出CV值
grep -h CV log*.out
CV error (K=1): 0.55248
CV error (K=2): 0.48190
CV error (K=3): 0.47835
CV error (K=4): 0.48236
CV error (K=5): 0.48985
#值越小越好相关参考网站：
【一起学生信】群体结构图形—structure堆叠图_探索者v的博客-CSDN博客_structure群体结构
科学网—群体结构分析之Structure 篇完整版（By Raindy） – 高芳銮的博文
Admixture：一款快速分析群体遗传结构的软件_.ped
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