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一、顺序不同：
原序列e5a48de588b034：AATTCCGG，
则反向序列为：GGCCTTAA 就是原序列反过来；
互补序列：TTAAGGCC 就是与原序列互补；
反向互补：CCGGAATT 就是与反向序列互补。
二、概念不同：
互补的概念就是A-T，C–G配对
要将核苷酸序列转换成反向互补序列，需要用DNASTAR软件，其中有EditSeq组件。
三、序列编码不同：
在用DNAMAN的多序列比对时，包括编码链和非编码连的比对，测序得到的目的片段可能是非编码链(即目的基因的编码链的互补序列)，而NCBI中提交的序列都是编码链的序列。
#!usr/bin/perl/-w
print “put in”;
$a=;
chomp($a);
@q=split (//,$a);
@p=reverse @q;
foreach my $i (@p){
if ($i eq “A”){print “T”;}
elsif ($i eq “T”){print “A”;}
elsif ($i eq “G”){print “C”;}
elsif ($i eq “C”){print “G”;}
}
扩展资料：
利用反向PCR可对未知序列扩增后进行分析，探索邻接已知DNA片段的序列，并可将仅知部分序列的全长cDNA进行分子克隆，建立全长的DNA探针。适用于基因游走、转位因子和已知序列DNA旁侧病毒整合位点分析等研究。
用传统的缓冲液和其他提供者推荐的条件裂解DNA。反向PCR所扩增的片段的大小由 PCR扩增片段的大小决定，PCR扩增的实际上限为3-4kb。
能裂解核心区的内切酶使反向PCR只能扩增引物所定模板(依赖于引物)的上游 或上游区，而不裂解核心区的酶则使两上边侧序列都扩增，并带有由内切酶和环化类 型决定的接点(例如，互补突头连接与钝头连接)。
发布者：全栈程序员-站长，转载请注明出处：https://javaforall.net/214093.html原文链接：https://javaforall.net
