matlab读.h5文件「建议收藏」

matlab读.h5文件「建议收藏」之前用python给nuswide提取了VGG19特征,因为文件太大,超过.mat限制,存成.h5,见[1]。现在一个matlab程序要读,可以用h5disp查看.h5文件内容的结构(各个datasets),然后用h5read读。注意两点:文件名的类型要是char而不能是string,否则报错好像被自动转置了一次?我当初存的时候应该是n×dn\timesdn×d的,但读出来的时候变成d×nd\timesnd×n了(不知道是h5py[1]在存

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之前用 python 给 nuswide 提取了 VGG19 特征,因为文件太大,超过 .mat 限制,存成 .h5,见 [1]。现在一个 matlab 程序要读,可以用 h5disp 查看 .h5 文件内容的结构(各个 datasets),然后用 h5read 读。

注意两点:

  • 文件名、dataset 的类型要是 char 而能是 string,否则报错。可以用 c = char(s) 将 string 转成 char
  • 好像被自动转置了一次?我当初存的时候应该是 n × d n\times d n×d 的,但读出来的时候变成 d × n d\times n d×n 了(不知道是 h5py[1] 在存的时候自己转了,还是 matlab 读的时候自己转的)

Code

% "双"引号 是 string,会报错
% F = "datasets/nuswide-tc10/images.nuswide.vgg19.4096d.h5";
% '单'引号 是 char(数组),可以
F = 'datasets/nuswide-tc10/images.nuswide.vgg19.4096d.h5';

% 打印文件内结构
h5disp(F);

% 读
images = h5read(F, '/images');  % dataset name 也要用****引号 char
fprintf("images:"), disp(size(images));  % (4096, 269648)
  • 输出
HDF5 images.nuswide.vgg19.4096d.h5 
Group '/' 
    Dataset 'images' 
        Size:  4096x269648
        MaxSize:  4096x269648
        Datatype:   H5T_IEEE_F32LE (single)
        ChunkSize:  []
        Filters:  none
        FillValue:  0.000000

images:        4096      269648

References

  1. h5py存取简例
  2. Importing HDF5 Files
  3. 利用matlab读取.h5文件内容
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