【R语言】敏感度、特异度、准确率检验及置信区间求解

【R语言】敏感度、特异度、准确率检验及置信区间求解来源函数 prop test 目的判断两个模型的敏感度 特异度 准确率是否有显著差异代码 TP1 模型一的真正例数量 TN1 模型一的真反例数量 FP1 模型一的假正例数量 FN1 模型一的假反例数量 TP2 模型二的真正例数量 TN2 模型二的真反例数量 FP2 模型二的假正例数量 FN2 模型二的假反例数量 x lt c TN1 TN2

来源

  • 包:stats
    • 函数:prop.test
    • 官方文档:https://www.rdocumentation.org/packages/stats/versions/3.6.2/topics/prop.test
  • 包:epiR
    • 函数:epi.tests
    • 官方文档:https://www.rdocumentation.org/packages/epiR/versions/1.0-10/topics/epi.tests

目的

  • 判断两个模型的敏感度、特异度、准确率是否有显著差异

代码

 统计学检验 # TP1:模型一的真正例数量 # TN1:模型一的真反例数量 # FP1:模型一的假正例数量 # FN1:模型一的假反例数量 # TP2:模型二的真正例数量 # TN2:模型二的真反例数量 # FP2:模型二的假正例数量 # FN2:模型二的假反例数量 x <- c(TN1,TN2); n <- c(TN1+FP1, TN2+FP2) # 特异度 prop.test(x,n, correct = T)$p.value x <- c(TP1,TP2); n <- c(TP1+FN1, TP2+FN2) # 敏感度 prop.test(x,n, correct = T)$p.value x <- c(TP1+TN1,TP2+TN2); n <- c(TP1+TN1+FP1+FN1, TP2+TN2+FP2+FN2) # 准确率 prop.test(x,n, correct = T)$p.value 置信区间求解 dat <- as.table(matrix(c(TP1, FN1, FP1, TN1), nrow = 2, byrow = TRUE)) epi.tests(dat) 

参考资料:

  1. https://journals.plos.org/plosmedicine/article/file?type=supplementary&id=info:doi/10.1371/journal.pmed..s001
  2. https://journals.plos.org/plosmedicine/article?id=10.1371/journal.pmed.
  3. http://vassarstats.net/clin1.html?tdsourcetag=s_pctim_aiomsg
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