用R语言绘制ROC曲线

用R语言绘制ROC曲线1roc曲线的意义ROC曲线就是用来判断诊断的正确性,最理想的就是曲线下的面积为1,比较理想的状态就是曲线下的面积在0.8-0.9之间,0.5的话对实验结果没有什么影响。如图:2代码部分install.packages(“pROC”)install.packages(“ggplot2”)library(pROC)library(ggplot2)#建立曲线data(aSAH)…

大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。

1、roc曲线的意义
ROC曲线就是用来判断诊断的正确性,最理想的就是曲线下的面积为1,比较理想的状态就是曲线下的面积在0.8-0.9之间,0.5的话对实验结果没有什么影响。
如图:
在这里插入图片描述
2、代码部分

install.packages("pROC")
install.packages("ggplot2")

library(pROC)
library(ggplot2)
#建立曲线
data(aSAH)
rocobj1<-roc(aSAH$outcome,aSAH$s100b)
rocobj2<-roc(aSAH$outcome,aSAH$wfns)
rocobj3<-roc(aSAH$outcome,aSAH$ndka)
#计算full AUC
auc(rocobj1)
auc(rocobj2)
auc(rocobj3)

#绘制曲线
plot(rocobj1)

#其他参数美化
plot(rocobj1,print.auc=TRUE,auc.polygon=TRUE,grid=c(0.1,0.2),grid.col=c("green","red"),max.auc.polygon=TRUE,auc.polygon.col="skyblue",print.thres=TRUE)

#计算partial  AUC选择关注一定范围数据

plot(rocobj1,print.auc=TRUE,auc.polygon=TRUE,partial.auc=c(0.8,0.4),partial.auc.focus="sp",grid=c(0.1,0.2),grid.col=c("green","red"),max.auc.polygon=TRUE,auc.polygon.col="skyblue",print.thres=TRUE,reuse.auc=FALSE)

#比较两个曲线,pROC提供三种方法比较“delong”, “bootstrap”或“venkatraman”
roc.test(rocobj1,rocobj2,method = "bootstrap")
#ggroc(功能仍在测试中)绘制Multiple curves
g3<-ggroc(list(s100b=rocobj,wfns=rocobj2,ndka=rocobj3))
g3

install.packages("pROC")
library("pROC")##roc
data(aSAH)
roc1<-roc(myData$label,myData$score)
roc2<-roc(myData2$label,myData2$score)
polt(roc1,col="blue")
polt.roc(roc2,add=TRUE,col="red")

3、实验结果
在这里插入图片描述

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请联系我们举报,一经查实,本站将立刻删除。

发布者:全栈程序员-站长,转载请注明出处:https://javaforall.net/145334.html原文链接:https://javaforall.net

(0)
全栈程序员-站长的头像全栈程序员-站长


相关推荐

  • FGC 2012

    FGC 2012JournalSpecialIssuesDistinguishedselectedpapersacceptedandpresentedinFGC2012,afterfurtherextensionandrevisions,willbepublishedinspecialissuesofthefollowingprestigiousSCI-Inde

    2022年6月19日
    33
  • 01_分布式电商系统搭建dubbo+zk+SpringBoot

    01_分布式电商系统搭建dubbo+zk+SpringBoot

    2021年7月12日
    85
  • 怎么从安卓设备转移数据到苹果_如何从安卓设备将数据转移到 iPhone 12?「建议收藏」

    怎么从安卓设备转移数据到苹果_如何从安卓设备将数据转移到 iPhone 12?「建议收藏」如果之前是安卓用户,在购买iPhone12新款手机之后,如何从安卓转移数据到iOS?可以通过苹果官方提供的“转移到iOS”应用,将安卓手机中的内容进行转移。可转移的内容包括:通讯录、信息历史记录、相机照片和视频、Web书签、邮件帐户和日历。转移完成之后,您可以从AppStore下载任何匹配的免费App。使用前准备事项:1.通过苹果官网下载“转移到iOS”应用,并在安卓手机中进…

    2022年9月18日
    3
  • simhash是什么_批复的适用情况

    simhash是什么_批复的适用情况需求是这样的:给出一个文档集合,以及一个领域概念集合,要求根据这些领域概念计算文档的相似性。首先想到的是利用余弦相似性计算。起初得到的集合有大概几万篇文档,如果对每对文档进行余弦相似度计算,会导致时间复杂度较高,于是发现了Simhash方法。由于已经给出了用于计算哈希值的关键词(即这些领域概念),就省去了对文章进行分词的步骤。每篇文档都用其领域概念列表计算出文档的哈希值,并使用这些

    2022年10月1日
    3
  • f stream_fstream

    f stream_fstreamofstream是从内存到硬盘,ifstream是从硬盘到内存,其实所谓的流缓冲就是内存空间;在C++中,有一个stream这个类,所有的I/O都以这个“流”类为基础的,包括我们要认识的文件I/O,stream这个类有两个重要的运算符:1、插入器(  向流输出数据。比如说系统有一个默认的标准输出流(cout),一般情况下就是指的显示器,所以,cout2、析取器(>>)  从流中输入数据

    2025年11月24日
    5
  • 数据结构与算法 队列_数据结构中的排序算法

    数据结构与算法 队列_数据结构中的排序算法一、什么是队列队列是一种特殊的线性表。队列元素的进出遵循“先进先出”原则:即只允许在前端(front)也就是队头进行删除操作,而只能在后端(rear)也就是队尾进行插入操作。如图所示:队列的最

    2022年8月16日
    6

发表回复

您的邮箱地址不会被公开。 必填项已用 * 标注

关注全栈程序员社区公众号